Mesane Kanseri Tedavisinde Kişisel Tıp Yaklaşımı: Genomik/Transkriptomik Analizler ve Tümör Modelleme

Mesane kanseri, dünya genelinde ve ülkemizde yüksek insidansa sahip kanserler arasında yer almaktadır. Mesane kanserinde kemoterapinin etkinliği aynı tanıyı alan, aynı tip, derece ve histolojik evrede olan hastalar arasında bile değişmektedir. Farklı hastalar arasında tedaviye cevaptaki bu farklılık tek tip tedavide zorluklar ortaya çıkarmakta hatta kemoterapiye dirençli hastalarda tedaviyi de geciktirmektedir. Bu sorunlara cevap arayan araştırmacılar kişisel tıp yaklaşımını öne sürmüştür. Bu yaklaşım kapsamlı genomik ve klinik analizlerin birlikte uygulanmasıyla mümkün olabilmektedir.

TÜSEB Türkiye Kanser Enstitüsü Ulusal Genom ve Biyoinformatik Projesi kapsamında gerçekleştirilen  bu çalışmada ülkemizde en sık görülen kanser türlerinden olan mesane kanserli hastaların tedaviden önce ve sonra genomik ve transkriptomik analizleri yapılarak Türkiye’de kişisel tıp alanında önderlik yapılması hedeflenmektedir. Bu hedefle Türkiye’den toplanan mesane kanseri taşıyan hastalarda genetik değişimleri analiz etmek için tüm genom dizileme yapılacak ve bu sekans verisini tamamlamak üzere gen ekspresyon değişimleri RNA seq ile belirlenecek ve klinik öykü ile eşleştirilerek biyoinformatik analizler yapılacaktır. Devamında hastalardan alınacak dokulardan organoid kültür biyobankaları oluşturulacak ve mesane kanserinde hasta kaynaklı tümör modeli oluşturulmasında alt yapı sağlanmış olacaktır. Bu kapsamlı genetik analizler ile mesane kanserinde değiştiği henüz bilinmeyen pek çok genin keşfine imkan sağlanabilecektir. Daha da önemlisi genetik değişimlerin ortaya konması ve klinik ile birlikte değerlendirilmesi tanı, prognoz, ilaç direnci, terapötik amaçlar veya özel hedefli terapilere cevap verebilecek hasta alt gruplarının tanımlanması için kullanılabilecek yeni biyobelirteçlerin ortaya çıkmasına da olanak sağlayacaktır.